RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360752.4

RDH16-201, Transcript of retinol dehydrogenase 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDH16, Length 3,198 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16-201ENST00000360752 LINC01546A6NGU7 62 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 UBE2D3P61077 147 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 UBE2D2P62837 147 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 Q8N1Y9 231 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PSMG4Q5JS54 123 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ELANEP08246 267 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 UBE2D1P51668 147 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 HERVK_113P61574 105 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.31□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 CFC1BP0CG36 223 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 CFC1P0CG37 223 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 LMO4P61968 165 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ZNF580Q9UK33 172 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 OVOL1O14753 267 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 TSHBP01222 138 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 CRYGDP07320 174 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.3□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 LINC00694P0DN24 101 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 KLRB1Q12918 225 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ODF3Q96PU9 254 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 VCX2Q9H322 139 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 MDFICQ9P1T7 246 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 RNF223E7ERA6 249 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PRM2P04554 102 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PRSS2P07478 247 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 JMJD1CQ15652 2540 aa7.29□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 C19orf84I3L1E1 186 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 DUX3Q96PT4 197 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 LRRK2Q5S007 2527 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PMVKQ15126 192 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 U3KQE9 123 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 A0A0J9YY99 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 KNCNA6PVL3 124 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RDH16-201ENST00000360752 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM223BA6NKX1 122 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 A4D1N5 150 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 J3QQQ9 107 aa7.27□□□□□ -1.25
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RDH16-201ENST00000360752 P0DMU3 169 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM231AP0DMU4 169 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM231CP0DMU5 169 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 SPXQ9BT56 116 aa7.27□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.27□□□□□ -1.25
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RDH16-201ENST00000360752 IGHV1-69P01742 117 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 A0A0J9YXV3 536 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 COX6B1P14854 86 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 PIEZO1Q92508 2521 aa7.26□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 SOCS3O14543 225 aa7.25□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 ZNF876PQ49A33 203 aa7.25□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 A0A0U1RRA0 63 aa7.25□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 A8MZ25 164 aa7.25□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 IGIPA6NJ69 53 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 LINC01620Q4KN68 170 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 C2orf82Q6UX34 121 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 NRGNQ92686 78 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 PROK1P58294 105 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 LINC01587Q99440 93 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 FBN2P35556 2912 aa7.24□□□□□ -1.25
RDH16-201ENST00000360752 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.24□□□□□ -1.25
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