RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 CRPP02741 224 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE12JA6NER3 117 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE4Q13068 117 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE5Q13069 117 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 SPEGQ15772 3267 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 K7EMT4 169 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 AGRNO00468 2067 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YY99 117 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 ELANEP08246 267 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01620Q4KN68 170 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 GPHB5Q86YW7 130 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01619G3V211 115 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PAX4O43316 350 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ZMAT4Q9H898 229 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PIEZO1Q92508 2521 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YX75 114 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IGHG4P01861 327 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CRYBA4P53673 196 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 INSL3P51460 131 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CFHR3Q02985 330 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SPTBN4Q9H254 2564 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IFITM1P13164 125 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 DAND5Q8N907 189 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 A6NDX4 124 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 Q9H8V8 135 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SLURP1P55000 103 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 A0A087WW49 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 U3KQE9 123 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 MT-ATP8P03928 68 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 B5MCH6 92 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PRSS47A8MTI9 375 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 P0DMU3 169 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 FAM231AP0DMU4 169 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 FAM231CP0DMU5 169 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PF4P02776 101 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 NRGNQ92686 78 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 HERVK_113P63121 156 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZUT4 128 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-201ENST00000345512 C19orf84I3L1E1 186 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP161Q6P656 301 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZS46 218 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM86BQ8N661 226 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE7O76087 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE12FP0CL80 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE12GP0CL81 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE12IP0CL82 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 PFN2P35080 140 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YXY3 114 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 M0QY20 66 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 GAGE6Q13070 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC2BQ92478 149 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM243Q9BU79 118 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB130BP0DP73 79 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB130AP0DP74 79 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 J3QLI3 93 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 LGALS9O00182 355 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-30P01768 117 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRU-201ENST00000345512 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.6□□□□□ -0.55
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