RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 VCYO14598 125 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 G0S2P27469 103 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PMCHL1Q16048 86 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.31□□□□□ -1.243e-10■■■□□ 16.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 HBDP02042 147 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 FCER1GP30273 86 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 LAGE3Q14657 143 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QY20 66 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 CIDEAO60543 219 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf79P0CE67 100 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL4Q99706 377 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf202A1L168 122 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01549A6NIU2 74 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TCAPO15273 167 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RS1O15537 224 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT3O95989 172 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PET117Q6UWS5 81 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC4Q99102 2169 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17DQ8TAD2 202 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5LO75964 103 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-53P01767 116 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZTI0 123 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LNJ9 63 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 I3L3M4 83 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS1P07477 247 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 EMP1P54849 157 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE12BA1L429 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MZ25 164 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TSTD3H0UI37 97 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE7O76087 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE12FP0CL80 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE12GP0CL81 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE12IP0CL82 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-11P60412 298 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 PKIAP61925 76 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11H2Q8NH07 326 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TOMM6Q96B49 74 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 VAMP8Q9BV40 100 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 LYRM9A8MSI8 78 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y8G0 127 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 MIFP14174 115 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOHQ15669 191 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB135Q30KP9 77 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N976 141 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF183Q96D59 192 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF479Q96JC4 524 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 C18orf15Q96N68 181 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 X6R8D5 127 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 MAST4O15021 2626 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01545Q5VT33 79 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZN92 141 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZSN1 163 aa7.22□□□□□ -1.25
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