RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 APCSP02743 223 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 HOXA5P20719 270 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 RPS10P46783 165 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 MRAP2Q96G30 205 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.75□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 F5H697 171 aa12.74□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.73□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 M0QY20 66 aa12.73□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.72□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 PPBPP02775 128 aa12.72□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.72□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.72□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.72□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 F5H768 121 aa12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 H7C1H1 209 aa12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 CKS2P33552 79 aa12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 ORMDL3Q8N138 153 aa12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 PRO0255Q9UI72 69 aa12.71□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 D6R8Y8 96 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 K7EQD1 137 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PHOX2AO14813 284 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 GAS8-AS1O95177 125 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 NCR2O95944 276 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 TRGC2P03986 189 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 CRYBA4P53673 196 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.71□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.7□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 SMKR1H3BMG3 65 aa12.7□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 RHOHQ15669 191 aa12.7□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 NRACQ8N912 160 aa12.69□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R17O96001 155 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 NIT2Q9NQR4 276 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 Q9UF83 564 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.68□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.67□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.67□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PAX4O43316 350 aa12.67□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PRELID3AQ96N28 172 aa12.67□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 H3BNG1 76 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PKHD1P08F94 4074 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 PKD1P98161 4303 aa12.66□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF6BO95407 300 aa12.65□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 NPYP01303 97 aa12.65□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 SRIP30626 198 aa12.65□□□□□ -0.38
PTX4-201ENST00000293922 A0A0J9YY99 117 aa12.64□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.64□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 M0R2N4 97 aa12.64□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 LINC00694P0DN24 101 aa12.64□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 C20orf78Q9BR46 151 aa12.64□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.63□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GYPEP15421 78 aa12.63□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.63□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 ST20Q9HBF5 79 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GAGE12JA6NER3 117 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 PRSS47A8MTI9 375 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 NUDT3O95989 172 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 UBE2D3P61077 147 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 UBE2D2P62837 147 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GAGE1Q13065 139 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GAGE4Q13068 117 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GAGE5Q13069 117 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 GAGE13Q4V321 117 aa12.62□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZR54 194 aa12.62□□□□□ -0.39
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PTX4-201ENST00000293922 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.61□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.61□□□□□ -0.39
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PTX4-201ENST00000293922 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.6□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.6□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 RTL8CO15255 209 aa12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.59□□□□□ -0.39
PTX4-201ENST00000293922 A0A096LPF7 62 aa12.58□□□□□ -0.4
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H2BKO60814 126 aa12.58□□□□□ -0.4
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H2BJP06899 126 aa12.58□□□□□ -0.4
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H2BOP23527 126 aa12.58□□□□□ -0.4
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