RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 ELANEP08246 267 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 FGF6P10767 208 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0J9YXV3 536 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PPM0 123 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 NRACQ8N912 160 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 BAALCQ8WXS3 180 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 C20orf78Q9BR46 151 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.41□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0J9YX75 114 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM262E9PQX1 116 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 GPHB5Q86YW7 130 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 CEND1Q8N111 149 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 U3KQK5 164 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf86A6NJI1 115 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 HTN3P15516 51 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE12JA6NER3 117 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB130BP0DP73 79 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB130AP0DP74 79 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE4Q13068 117 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE5Q13069 117 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE13Q4V321 117 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.4□□□□□ -0.9
UBXN4-201ENST00000272638 CIDEAO60543 219 aa9.4□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF415Q09FC8 603 aa9.4□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.39□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 C12orf74Q32Q52 190 aa9.39□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 ATP6V0BQ99437 205 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 U3KQE9 123 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 INSP01308 110 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 CUBNO60494 3623 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 I3L3M4 83 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE7O76087 117 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE12FP0CL80 117 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE12GP0CL81 117 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 GAGE12IP0CL82 117 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.38□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 J3QLI3 93 aa9.37□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 K7EP34 96 aa9.37□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 PSMB8P28062 276 aa9.37□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.37□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.37□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 K7EMT4 169 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 SPINK8P0C7L1 97 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 A0A096LPF7 62 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 J3QQQ9 107 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 K7EQG2 157 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.36□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 DCANP1Q8TF63 244 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV1-40P01703 118 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF843Q8N446 348 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 TOMM6Q96B49 74 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 CCL24O00175 119 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 AZU1P20160 251 aa9.35□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 WFDC2Q14508 124 aa9.34□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 DAND5Q8N907 189 aa9.34□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.34□□□□□ -0.91
UBXN4-201ENST00000272638 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.34□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 CNFNQ9BYD5 112 aa9.34□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.34□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 ATRQ13535 2644 aa9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 IGLL5B9A064 214 aa9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 SIVA1O15304 175 aa9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 Q6YL49 198 aa9.32□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF702PQ9H963 129 aa9.32□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 ERG28Q9UKR5 140 aa9.32□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 NF1P21359 2839 aa9.32□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GV72 72 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 M0R2P5 195 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 ESM1Q9NQ30 184 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 A8MZ25 164 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM141Q96I45 108 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 A8MWV9 139 aa9.31□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 COX6CP09669 75 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM101Q96IK0 257 aa9.3□□□□□ -0.92
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms