RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf78Q9BR46 151 aa8.77□□□□□ -1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIVA1O15304 175 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED14OSP0DP75 135 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCSHP23434 173 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q5PR19 223 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N1Y9 231 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BUT2 72 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HTN1P15515 57 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLURP1P55000 103 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOMM6Q96B49 74 aa8.77□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRM2P04554 102 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FXYD2P54710 66 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JMJD8Q96S16 334 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.76□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NDN8 102 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NXPH4O95158 308 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FSHBP01225 129 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EMP1P54849 157 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q96MF0 132 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F8VRH5 84 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDKN1BP46527 198 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KNCNA6PVL3 124 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H7C1H1 209 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7ERJ3 54 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELANEP08246 267 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAALCQ8WXS3 180 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM89A2RUT3 159 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLNP26678 52 aa8.74□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf118A6NHY6 69 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BRM9 83 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SVIPQ8NHG7 77 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NACAE9PAV3 2078 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DRB4P13762 266 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.73□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE10A6NGK3 116 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSHBP01222 138 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF56Q15929 161 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR11H1Q8NG94 326 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf85Q96MD7 179 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS9O00182 355 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB131AP59861 70 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMTNQ6UX39 209 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOTCH2Q04721 2471 aa8.72□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12BA1L429 117 aa8.71□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYGDP07320 174 aa8.71□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COTL1Q14019 142 aa8.71□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF876PQ49A33 203 aa8.71□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIGD1BQ9P298 99 aa8.71□□□□□ -1.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R17O96001 155 aa8.71□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.71□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ODF3Q96PU9 254 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR2DL4Q99706 377 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0QY20 66 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VCYO14598 125 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGIPA6NJ69 53 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR11H12B2RN74 326 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM13P0DJ93 91 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEND1Q8N111 149 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF152Q8N8N0 203 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR11H2Q8NH07 326 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CST9LQ9H4G1 147 aa8.69□□□□□ -1.02
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