RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPX	Q9BT56	116 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0R2P5	195 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAMP	P49913	170 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZTI0	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TG	P01266	2768 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	NXPH4	O95158	308 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB4A	P20338	218 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNG7	P62955	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIG	Q13278	110 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	JPT2	Q9H910	190 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GXF2	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASL10A	Q92737	203 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HBB	P68871	147 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVI2A	P22794	236 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DKK2	Q9UBU2	259 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELA1	Q9UNI1	258 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0J9YWU9	116 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE7	O76087	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB130B	P0DP73	79 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB130A	P0DP74	79 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPS	P0C0P6	89 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRZB	Q92765	325 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTH2	Q96A98	100 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WWL8	130 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP1S3	Q96PC3	154 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GW15	77 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYRM9	A8MSI8	78 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLEU1	O43261	78 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MWV9	139 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYGD	P07320	174 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	COTL1	Q14019	142 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-53	P01767	116 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM17	P0DL12	118 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	RS1	O15537	224 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCGB1D1	O95968	90 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00315	P59091	139 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAD1	P61803	113 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLA	Q13239	276 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	MGP	P08493	103 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE1	Q13065	139 aa		6.49	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms