RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 RHEBQ15382 184 aa12.76□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 WDR73Q6P4I2 378 aa12.76□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CTDSP1Q9GZU7 261 aa12.76□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 A0A0J9YY99 117 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 FHL2Q14192 279 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CNFNQ9BYD5 112 aa12.75□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CIDEAO60543 219 aa12.74□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 MGPP08493 103 aa12.74□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 RIGQ13278 110 aa12.74□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF56Q15929 161 aa12.74□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.74□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CRYGDP07320 174 aa12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CASC10Q5T4H9 136 aa12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 PRO0255Q9UI72 69 aa12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.73□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 F5H697 171 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 PAX4O43316 350 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 EVI2AP22794 236 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 SLAQ13239 276 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.72□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 A0A087WWC5 75 aa12.71□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 CRYBA4P53673 196 aa12.71□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 FAM210BQ96KR6 192 aa12.71□□□□□ -0.37
MFGE8-214ENST00000560937 NUDT3O95989 172 aa12.7□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 S100PP25815 95 aa12.7□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.7□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 K7EQD1 137 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 CAMPP49913 170 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 RHOHQ15669 191 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 IMMP2LQ96T52 175 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.69□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 RAB4BP61018 213 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 HBBP68871 147 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 Q6ZSN1 163 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 TMEM242Q9NWH2 141 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.68□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1B0GW15 77 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 S100A8P05109 93 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 GYPEP15421 78 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 BTF3L4Q96K17 158 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.67□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 H3BNG1 76 aa12.66□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.66□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 APLNQ9ULZ1 77 aa12.66□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 P0DMU3 169 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 FAM231AP0DMU4 169 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 FAM231CP0DMU5 169 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 TCTAP57738 103 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 LINC00315P59091 139 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.65□□□□□ -0.38
MFGE8-214ENST00000560937 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.64□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1B0GXF2 115 aa12.64□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 SRIP30626 198 aa12.64□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 A0A096LPF7 62 aa12.63□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 H7C1H1 209 aa12.63□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 AMN1Q8IY45 258 aa12.63□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GAGE12JA6NER3 117 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GAGE1Q13065 139 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GAGE4Q13068 117 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GAGE5Q13069 117 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GAGE13Q4V321 117 aa12.62□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.61□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 RAB4AP20338 218 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 RASL11AQ6T310 242 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 RNF185Q96GF1 192 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 Q9UF83 564 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.6□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 M0QY20 66 aa12.59□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.59□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.59□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.59□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 GATD1Q8NB37 220 aa12.59□□□□□ -0.39
MFGE8-214ENST00000560937 ATP6V1G1O75348 118 aa12.58□□□□□ -0.4
MFGE8-214ENST00000560937 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms