RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542635.5

SLFN13-211, Transcript of schlafen family member 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLFN13, Length 5,921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13-211ENST00000542635 FOXI1Q12951 378 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 CTSGP08311 255 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 MPDZO75970 2070 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 Q8TCH9 128 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 GTSF1Q8WW33 167 aa7.22□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.21□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 C14orf177Q52M58 125 aa7.21□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.21□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.21□□□□□ -1.25
SLFN13-211ENST00000542635 J3QKU1 62 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 LINC00643Q86TS7 51 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 LYPD6Q86Y78 171 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 A0A096LNI7 61 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 Q6ZS92 163 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.21□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 G3V4G9 280 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 WT1-ASQ06250 92 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 WFDC2Q14508 124 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 POLEQ07864 2286 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 LINC00311Q8N616 119 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 KLK12Q9UKR0 248 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ZNF726P1Q15940 193 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 Q8N1Y9 231 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.2□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 SPRY2O43597 315 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 IGLV3-1P01715 115 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 DEFB136Q30KP8 78 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 CADP27708 2225 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 TTC28Q96AY4 2481 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 COL4A3Q01955 1670 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 A0A0J9YWU9 116 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 IL17DQ8TAD2 202 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 SLURP1P55000 103 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.18□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 Q8N9L7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 CACNA1GO43497 2377 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 A0A087WZ39 114 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 UQCRQO14949 82 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ROS1P08922 2347 aa7.17□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 IGHV2-5P01817 119 aa7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 FXYD2P54710 66 aa7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 SCXQ7RTU7 201 aa7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 K7EN84 100 aa7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 SERP2Q8N6R1 65 aa7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.15□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 HIGD1BQ9P298 99 aa7.15□□□□□ -1.26
SLFN13-211ENST00000542635 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 Q8N9W7 124 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 C11orf86A6NJI1 115 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 Q6ZSR3 168 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 PIP4P1Q86T03 277 aa7.15□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 UBE2D1P51668 147 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 E9PLD3 99 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 PRR4Q16378 134 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 ENHOQ6UWT2 76 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 Q8NFD4 153 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 C9orf85Q96MD7 179 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 DEFB135Q30KP9 77 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 DEFB4AO15263 64 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 C1orf195Q5TG92 126 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 TOMM6Q96B49 74 aa7.14□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.13□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 RETNQ9HD89 108 aa7.13□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.13□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.13□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 LYRM9A8MSI8 78 aa7.12□□□□□ -1.27
SLFN13-211ENST00000542635 NDUFC1O43677 76 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms