RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 LEAP2Q969E1 77 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 RAB37Q96AX2 223 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 KIR2DL4Q99706 377 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.56□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 CACNA1HO95180 2353 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 MED13Q9UHV7 2174 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 TMEM213A2RRL7 107 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 RBAKDNA6NC62 111 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 TMEM262E9PQX1 116 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 F8VRH5 84 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 LYZL6O75951 148 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 CKS2P33552 79 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 PRR4Q16378 134 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.55□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 TEN1Q86WV5 123 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 K7ENP7 123 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 INSL3P51460 131 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 ATP5G2Q06055 141 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 FAM201AQ5SY85 155 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 RPEQ96AT9 228 aa3.54□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 M0R381 172 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 NDUFA3O95167 84 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 APOMO95445 188 aa3.53□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 SPINK8P0C7L1 97 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 TOMM6Q96B49 74 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 CCL13Q99616 98 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRDN-204ENST00000542443 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.53□□□□□ -1.84
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TRDN-204ENST00000542443 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 LY6G6DO95868 133 aa3.52□□□□□ -1.85
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TRDN-204ENST00000542443 P0DMU3 169 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 FAM231AP0DMU4 169 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 FAM231CP0DMU5 169 aa3.52□□□□□ -1.85
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 LYZP61626 148 aa3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRDN-204ENST00000542443 ERCC8Q13216 396 aa3.52□□□□□ -1.85
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