RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	AZU1	P20160	251 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		Q96MF0	132 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V0B	Q99437	205 aa		6.21	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LEPROT	O15243	131 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	JPT2	Q9H910	190 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	RNF114	Q9Y508	228 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV12-3	P01733	135 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ELANE	P08246	267 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	PFN2	P35080	140 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YXV3	536 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		6.2	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGLL5	B9A064	214 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		H3BUA1	57 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ODF1	Q14990	250 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A20	O43772	301 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE6	Q13070	117 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC2	Q14508	124 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SIRPD	Q9H106	197 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LRRK2	Q5S007	2527 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		6.19	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	MTOR	P42345	2549 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SLURP1	P55000	103 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LRP4	O75096	1905 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		H3BMM0	161 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CRIP1	P50238	77 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		6.18	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		U3KQE9	123 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N1Y9	231 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		J3QLI3	93 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	NXPH4	O95158	308 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CRYGB	P07316	175 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CFC1B	P0CG36	223 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CFC1	P0CG37	223 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	RHOH	Q15669	191 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		A4D1N5	150 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	MYCNOS	P40205	109 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LMO4	P61968	165 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf86	A6NJI1	115 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SS18	Q15532	418 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf42	Q9H799	3197 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193		A0A096LPF7	62 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGF1	P05019	195 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.16	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGHG2	P01859	326 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	POLQ	O75417	2590 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00310	P59036	64 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	HIGD1B	Q9P298	99 aa		6.15	□□□□□ -1.42
NEK1-208	ENST00000512193	CARD19	Q96LW7	228 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		Q9H8V8	135 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WW49	117 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	PRB1	P04280	392 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		6.15	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		E9PLD3	99 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		F5H768	121 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-11	P01706	119 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	LY6L	H3BQJ8	138 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	HERVK_113	P63121	156 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM6	Q96B49	74 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	DAND5	Q8N907	189 aa		6.13	□□□□□ -1.43

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