RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BVH4 76 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 PEA15Q15121 130 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 BAGE2Q86Y30 109 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 IL36BQ9NZH7 164 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 PDE6DO43924 150 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC01559Q495D7 138 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 DNLZQ5SXM8 178 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 A8MWV9 139 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 GCSHP23434 173 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 RHOHQ15669 191 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 COMMD7Q86VX2 200 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SYT8Q8NBV8 401 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 K7EP13 123 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 C11orf52Q96A22 123 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 MLST8Q9BVC4 326 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 PARLQ9H300 379 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 NDUFA5Q16718 116 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 UQCC3Q6UW78 93 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 JPT2Q9H910 190 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM250H0YL14 139 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 EVI2AP22794 236 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 HAMPP81172 84 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 PRR27Q6MZM9 219 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 DERL1Q9BUN8 251 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM229AH3BQW9 127 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 M0R381 172 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 Q6ZSN1 163 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 ZFP82Q8N141 532 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 C9JQL5 133 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 RHODO00212 210 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 CRYGDP07320 174 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 CXCL1P09341 107 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 CEBPGP53567 150 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 TIRAPP58753 221 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 CENPWQ5EE01 88 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.27□□□□□ -0.92
SH3BP2-205ENST00000502260 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SFRP2Q96HF1 295 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A087WWL8 130 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GAGE12JA6NER3 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GNG4P50150 75 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GAGE1Q13065 139 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GAGE4Q13068 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GAGE5Q13069 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GAGE13Q4V321 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM12Q96EX1 92 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM218A2RU14 115 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF727A8MUV8 499 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SNAI2O43623 268 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 IGLV2-8P01709 118 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 OR5AL1P0C617 328 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 LELP1Q5T871 98 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-205ENST00000502260 J3QL48 77 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms