RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 PSCAO43653 123 aa9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 SH2D1AO60880 128 aa9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 JPT2Q9H910 190 aa9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 Q9UF83 564 aa9.45□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 B4DEV8 164 aa9.44□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 M0R036 132 aa9.44□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.44□□□□□ -0.9
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TAPBP-241ENST00000489157 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TAPBP-241ENST00000489157 ASIPP42127 132 aa9.44□□□□□ -0.9
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TAPBP-241ENST00000489157 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.43□□□□□ -0.9
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TAPBP-241ENST00000489157 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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TAPBP-241ENST00000489157 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
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TAPBP-241ENST00000489157 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.32□□□□□ -0.92
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TAPBP-241ENST00000489157 RHODO00212 210 aa9.32□□□□□ -0.92
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TAPBP-241ENST00000489157 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.32□□□□□ -0.92
TAPBP-241ENST00000489157 BIN3Q9NQY0 253 aa9.32□□□□□ -0.92
TAPBP-241ENST00000489157 A0A087WWC5 75 aa9.31□□□□□ -0.92
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