RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		Q8N976	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		B4DEV8	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		G3V3Q6	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	RHOD	O00212	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FHIT	P49789	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6ZSA8	131 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	PARL	Q9H300	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BVH4	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF345	Q14585	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A087WWC5	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		A6NJY4	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		M0R036	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	SH2D1A	O60880	128 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LTA	P01374	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	AKR1C3	P42330	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE1	Q13065	139 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE4	Q13068	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE5	Q13069	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A0D9SG52	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	PFDN1	O60925	122 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	CRIP1	P50238	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	WFDC2	Q14508	124 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	XP32	Q5T750	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A087WX48	190 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100		M0R381	172 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	BCL2L11	O43521	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	PAGE4	O60829	102 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	CXCL1	P09341	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	ELOB	Q15370	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	JPT2	Q9H910	190 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	CRP	P02741	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A087WWL8	130 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1B0GV50	99 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	NIT1	Q86X76	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100		Q8N3U1	123 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-223	ENST00000489100	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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