RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U3KQE9 123 aa12.84□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.84□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.84□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL25O15444 150 aa12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.83□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PPM0 123 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 J3QKU1 62 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEND1Q8N111 149 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BUA1 57 aa12.82□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBAKDNA6NC62 111 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BMM0 161 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2WQ96B02 151 aa12.81□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01548A6NM66 108 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL24O00175 119 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV12-3P01733 135 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYGCP07315 174 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLQO75417 2590 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCFC1P51610 2035 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EP34 96 aa12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf74Q32Q52 190 aa12.79□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8W1H4 67 aa12.79□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.79□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0J9YY99 117 aa12.79□□□□□ -0.36
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.78□□□□□ -0.36
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WW49 117 aa12.77□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSCAO43653 123 aa12.77□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01545Q5VT33 79 aa12.77□□□□□ -0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N1Y9 231 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB125Q8N687 156 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFITM1P13164 125 aa12.76□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIRPDQ9H106 197 aa12.76□□□□□ -0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf38Q86SI9 138 aa12.74□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8WEM9 126 aa12.74□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q9H8V8 135 aa12.74□□□□□ -0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-8P01709 118 aa12.73□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.73□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK2AP2O75956 126 aa12.73□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.73□□□□□ -0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMO4P61968 165 aa12.72□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERVK_113P63121 156 aa12.72□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAL2Q16559 108 aa12.72□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZQT7 251 aa12.72□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.72□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHG2P01859 326 aa12.71□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXYD2P54710 66 aa12.71□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOHQ15669 191 aa12.71□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf70A6NJV1 201 aa12.71□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf84I3L1E1 186 aa12.71□□□□□ -0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBL5Q9BZL1 73 aa12.71□□□□□ -0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRACP01848 142 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARD19Q96LW7 228 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDFICQ9P1T7 246 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.7□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC140Q96MF4 163 aa12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFC1BP0CG36 223 aa12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFC1P0CG37 223 aa12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTRLP40313 264 aa12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.69□□□□□ -0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.69□□□□□ -0.38
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