RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GW15 77 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12BA1L429 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 D6R8Y8 96 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 M0R381 172 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 NPYP01303 97 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 S100A8P05109 93 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR5AL1P0C617 328 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 HTN1P15515 57 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RAB4AP20338 218 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TSPOP30536 169 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CDKN1BP46527 198 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PMCHL1Q16048 86 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 NIT1Q86X76 327 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf57Q99622 126 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CNFNQ9BYD5 112 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 JPT2Q9H910 190 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 U3KQK5 164 aa4.48□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR11H12B2RN74 326 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ESDP10768 282 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CACNG7P62955 275 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 Q8N1X5 172 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM18Q96B42 140 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 KCNS1Q96KK3 526 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PRELID3AQ96N28 172 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CITED1Q99966 193 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 XCL2Q9UBD3 114 aa4.47□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PRYO14603 147 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NPSP0C0P6 89 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 CKS2P33552 79 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 AMTP48728 403 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 DNLZQ5SXM8 178 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 STHQ8IWL8 128 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C9orf85Q96MD7 179 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.46□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 CBY3A6NI87 242 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NXPH4O95158 308 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MGPP08493 103 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM6P0DI80 62 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 AZU1P20160 251 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00315P59091 139 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 TDRG1Q3Y452 100 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 ORMDL3Q8N138 153 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB125Q8N687 156 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IL17DQ8TAD2 202 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01587Q99440 93 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF747Q9BV97 191 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NIT2Q9NQR4 276 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NACAE9PAV3 2078 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.45□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 A4D1N5 150 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 HSBP1O75506 76 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 INSP01308 110 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00614P0C842 121 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IGLL1P15814 213 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 KRTDAPP60985 99 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 FA2HQ7L5A8 372 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NRACQ8N912 160 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 Q8N976 141 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.44□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C3orf79P0CE67 100 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF876PQ49A33 203 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 RASL10AQ92737 203 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms