RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM18Q96B42 140 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 PRELID3AQ96N28 172 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 M0R381 172 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 INSP01308 110 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 CRYGDP07320 174 aa7□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZWC4 215 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 STHQ8IWL8 128 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 IL17DQ8TAD2 202 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 TNFRSF6BO95407 300 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 NCR2O95944 276 aa6.99□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 Q8N976 141 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 MRAP2Q96G30 205 aa6.99□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 JPT2Q9H910 190 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 XCL2Q9UBD3 114 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 RASL10AQ92737 203 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 CBY3A6NI87 242 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 IGLL1P15814 213 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 AMTP48728 403 aa6.97□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 AP1S3Q96PC3 154 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 LINC01587Q99440 93 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 C12orf57Q99622 126 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA6-210ENST00000475302 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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ITGA6-210ENST00000475302 PMCHP20382 165 aa6.96□□□□□ -1.3
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ITGA6-210ENST00000475302 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.96□□□□□ -1.3
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ITGA6-210ENST00000475302 M0QY20 66 aa6.95□□□□□ -1.3
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ITGA6-210ENST00000475302 ZNF876PQ49A33 203 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.95□□□□□ -1.3
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ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WWL8 130 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C3orf79P0CE67 100 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.94□□□□□ -1.3
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ITGA6-210ENST00000475302 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 MAST4O15021 2626 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 ATRQ13535 2644 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 RS1O15537 224 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 HTN1P15515 57 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP10-11P60412 298 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 FA2HQ7L5A8 372 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 CSTL1Q9H114 145 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 VWFP04275 2813 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.92□□□□□ -1.3
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