RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-204ENST00000409937 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-204ENST00000409937 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 CCL19Q99731 98 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 MDFICQ9P1T7 246 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 TGFAP01135 160 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 PSMG4Q5JS54 123 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 APOMO95445 188 aa10.51□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.51□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ATP5J2P56134 94 aa10.51□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SVIPQ8NHG7 77 aa10.51□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 LINC01549A6NIU2 74 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 USMG5Q96IX5 58 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 TAL2Q16559 108 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 DCANP1Q8TF63 244 aa10.5□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 KLLNB2CW77 178 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 COX6B1P14854 86 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGHV4-59P01825 116 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 PRM2P04554 102 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF56Q15929 161 aa10.49□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 FBN2P35556 2912 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGLV1-40P01703 118 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 HTN1P15515 57 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGIPA6NJ69 53 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 GAGE13Q4V321 117 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 PRO0461Q9UI25 63 aa10.48□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 NXPH4O95158 308 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 AZU1P20160 251 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ATP6V0BQ99437 205 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.47□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 MSMBP08118 114 aa10.46□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 MED14OSP0DP75 135 aa10.46□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 Q8N1Y9 231 aa10.46□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 PTH2Q96A98 100 aa10.46□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF580Q9UK33 172 aa10.46□□□□□ -0.73
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GWB2 263 aa10.46□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 TSPAN13O95857 204 aa10.46□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PSMB2P49721 201 aa10.46□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 F8W1H4 67 aa10.45□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 SYNJ2BPP57105 145 aa10.45□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 CFHR3Q02985 330 aa10.45□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PMVKQ15126 192 aa10.45□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 KIR2DL4Q99706 377 aa10.45□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 A0A0J9YY99 117 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PRB1P04280 392 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 P0DMU3 169 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 FAM231AP0DMU4 169 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 FAM231CP0DMU5 169 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ID1P41134 155 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.44□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 H3BUA1 57 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PROK1P58294 105 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 A0A087WW49 117 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 GAGE12HA6NDE8 117 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 VCYO14598 125 aa10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 A0A0J9YX75 114 aa10.42□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PSMB8P28062 276 aa10.42□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 UBE2D1P51668 147 aa10.42□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 Q9UF83 564 aa10.42□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.41□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 LINC01619G3V211 115 aa10.41□□□□□ -0.74
CNGA3-204ENST00000409937 H7C2G1 150 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms