RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 C19orf84I3L1E1 186 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SAP30O75446 220 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 GAGE2BQ13066 116 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 GAGE2EQ4V326 116 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 MDFICQ9P1T7 246 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PLXNB1O43157 2135 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SOCS3O14543 225 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 CRYBA4P53673 196 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 DNAL4O96015 105 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 ETDBQ3ZM63 59 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 LAMA3Q16787 3333 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 Q8N1Y9 231 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 K7EQG2 157 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 NXPH4O95158 308 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 GAS8-AS1O95177 125 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SPRY2O43597 315 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 KNCNA6PVL3 124 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SPINK8P0C7L1 97 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 RNF223E7ERA6 249 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 CFC1BP0CG36 223 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 CFC1P0CG37 223 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 C9orf85Q96MD7 179 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 PSMB8P28062 276 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1BQ00975 2339 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RRA0 63 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 AMTNQ6UX39 209 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 IFITM1P13164 125 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 DEFB1P60022 68 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 HERVK_113P63121 156 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPR1 153 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 C9JAW5 83 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 WFDC2Q14508 124 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 DCANP1Q8TF63 244 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 M0QY20 66 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 AZU1P20160 251 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TMEM86BQ8N661 226 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 NFE4Q86UQ8 179 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 A0A0B4J2C4 111 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A20O43772 301 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 C2orf82Q6UX34 121 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 Q6YL49 198 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TMEM223A0PJW6 202 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 JPT2Q9H910 190 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YY99 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TEN1Q86WV5 123 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 FOXI1Q12951 378 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 CITED1Q99966 193 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YXV3 536 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 IGIPA6NJ69 53 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 NPC2P61916 151 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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