RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 FAM223BA6NKX1 122 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA4O00483 81 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A6NDN8 102 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 VWFP04275 2813 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 H3BMG7 143 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A16P16260 332 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SMPXQ9UHP9 88 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WX48 190 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PPM0 123 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DRB4P13762 266 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SLURP1P55000 103 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SEC11AP67812 179 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ZNF56Q15929 161 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 BAALCQ8WXS3 180 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ZMAT4Q9H898 229 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WW49 117 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 TSHBP01222 138 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SMIM13P0DJ93 91 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 Q8N1Y9 231 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PRX2 142 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 H3BRM9 83 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 WFDC2Q14508 124 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 DCANP1Q8TF63 244 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 SCGB2A2Q13296 93 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 C11orf86A6NJI1 115 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 APOMO95445 188 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 K7EP34 96 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 CRYGDP07320 174 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 INSL3P51460 131 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 LINC00315P59091 139 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 CEND1Q8N111 149 aa6.45□□□□□ -1.38
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GINS1-201ENST00000262460 H7C2G1 150 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 OVOL1O14753 267 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ATP5LO75964 103 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 IGLV1-40P01703 118 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZNF815PA8K554 130 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 FABP2P12104 132 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 A8MZ25 164 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 OR11H12B2RN74 326 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 B4DSR2 109 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 F8VRH5 84 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 CDKN1BP46527 198 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 OR11H1Q8NG94 326 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 OR11H2Q8NH07 326 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 H7C1H1 209 aa6.43□□□□□ -1.38
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GINS1-201ENST00000262460 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 C12orf74Q32Q52 190 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZNF876PQ49A33 203 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 TOMM6Q96B49 74 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 USMG5Q96IX5 58 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ETDBQ3ZM63 59 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 IGLL5B9A064 214 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 DEFB131AP59861 70 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 MRAP2Q96G30 205 aa6.42□□□□□ -1.38
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