RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 SMIM12Q96EX1 92 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 MLST8Q9BVC4 326 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 IL36BQ9NZH7 164 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 CRYBA4P53673 196 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 FHL2Q14192 279 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 TOR2AQ5JU69 321 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 DNLZQ5SXM8 178 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PTH2Q96A98 100 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 A0A096LPF7 62 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 RAB19A4D1S5 217 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 A8MWV9 139 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 RS1O15537 224 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 CXCL1P09341 107 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 MED14OSP0DP75 135 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 ZFP82Q8N141 532 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 BIN3Q9NQY0 253 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 TMEM250H0YL14 139 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 M0R381 172 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 CIDEAO60543 219 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 IGLV2-8P01709 118 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 GYPEP15421 78 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 SRIP30626 198 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 CEBPGP53567 150 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 TEX261Q6UWH6 196 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 PARLQ9H300 379 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-214ENST00000625905 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 NACAE9PAV3 2078 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 LYSTQ99698 3801 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 RHODO00212 210 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 P01737 135 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 RHOHQ15669 191 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 FAM210AQ96ND0 272 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 XKRY2A2RUG3 117 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 K7EQD1 137 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 M0R2N4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 NXPH4O95158 308 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ESRGQ1W209 222 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 TPPP3Q9BW30 176 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 A0A087WWL8 130 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SNAI2O43623 268 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 OR5AL1P0C617 328 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ZNF575Q86XF7 245 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 UPK3BQ9BT76 320 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 JPT2Q9H910 190 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ZNF727A8MUV8 499 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 K7EN84 100 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 GZMBP10144 247 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 TTC32Q5I0X7 151 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZR54 194 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SFRP2Q96HF1 295 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 AP1S3Q96PC3 154 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 IGLC6P0CF74 106 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-214ENST00000625905 ZNF56Q15929 161 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.2 ms