RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 H3BTX0 84 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 EREGO14944 169 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ORM1P02763 201 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 TRGV3P03979 118 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DRB4P13762 266 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ARL3P36405 182 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ID1P41134 155 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 SEC11AP67812 179 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.12□□□□□ -1.43
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GGA3-218ENST00000584243 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 SGK494Q96LW2 274 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 CCDC140Q96MF4 163 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ODF3Q96PU9 254 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 TPPP3Q9BW30 176 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.12□□□□□ -1.43
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GGA3-218ENST00000584243 SNAI2O43623 268 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 CRIP1P50238 77 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 DLX1P56177 255 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 KIR3DS1Q14943 382 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ZNF738Q8NE65 137 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 GLMPQ8WWB7 406 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C16orf92Q96LL3 132 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C17orf77Q96MU5 243 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 A6NDX4 124 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 M0R381 172 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 COX8AP10176 69 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 CD24P25063 80 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZSV7 163 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C20orf78Q9BR46 151 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 A6NDN8 102 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 PLNP26678 52 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 FCER1GP30273 86 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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GGA3-218ENST00000584243 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C8orf49Q96NF6 230 aa6.09□□□□□ -1.43
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GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C7orf71A4D174 169 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGLV1-40P01703 118 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGHG4P01861 327 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 CD33P20138 364 aa6.08□□□□□ -1.44
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GGA3-218ENST00000584243 ASIPP42127 132 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TDRG1Q3Y452 100 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 GPHB5Q86YW7 130 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 AP1S3Q96PC3 154 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 VGLL1Q99990 258 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.08□□□□□ -1.44
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GGA3-218ENST00000584243 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.07□□□□□ -1.44
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GGA3-218ENST00000584243 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 LEPP41159 167 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 C16orf95Q9H693 158 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 COX11Q9Y6N1 276 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 G3V318 75 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 H3BUX3 64 aa6.06□□□□□ -1.44
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