RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 C9JCJ5 164 aa6.12□□□□□ -1.43
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CLSTN3-212ENST00000541770 TYMSP04818 313 aa6.12□□□□□ -1.43
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CLSTN3-212ENST00000541770 CEBPGP53567 150 aa6.12□□□□□ -1.43
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.11□□□□□ -1.43
CLSTN3-212ENST00000541770 GNRH2O43555 120 aa6.11□□□□□ -1.43
CLSTN3-212ENST00000541770 SPINK4O60575 86 aa6.11□□□□□ -1.43
CLSTN3-212ENST00000541770 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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CLSTN3-212ENST00000541770 SFTA3P0C7M3 94 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-212ENST00000541770 SNAI2O43623 268 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 NUDT3O95989 172 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 APOC3P02656 99 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AL1P0C617 328 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ADCYAP1P18509 176 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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