RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6V1FQ16864 119 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 C5orf47Q569G3 176 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SCXQ7RTU7 201 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF546Q86UE3 836 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 Q8N814 137 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 BAALCQ8WXS3 180 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 FKBP14Q9NWM8 211 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 FUT9Q9Y231 359 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 V9GYY9 64 aa2.01□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0A6YYH2 397 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1B0GW15 77 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RBFOX3A6NFN3 312 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 A6NJ64 397 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SNRPGP15A8MWD9 76 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 H3BNG1 76 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 GABARAPH6UMI1 98 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 H7BYZ3 331 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CCNKO75909 580 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 GABARAPO95166 117 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 FABP1P07148 127 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SRIP30626 198 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 HRH1P35367 487 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 NMUP48645 174 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TAS2R46P59540 309 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SPCS3P61009 180 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0087Q14695 138 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00483Q53H64 154 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 OR8A1Q8NGG7 326 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TP53RKQ96S44 253 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM147Q9BVK8 224 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 MCUBQ9NWR8 336 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 COPZ2Q9P299 210 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 NAGKQ9UJ70 344 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SSR3Q9UNL2 185 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 LRP2P98164 4655 aa2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV5A0A0B4J249 113 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 A8MTW9 85 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 INS-IGF2F8WCM5 200 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SMKR1H3BMG3 65 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R2P9O14990 202 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 MPDU1O75352 247 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TNFAIP8O95379 198 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 C1QBP02746 253 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 OR5G3P0C626 314 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SDC2P34741 201 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS3P35030 304 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RCVRNP35243 200 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PIGPP57054 158 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 UBE2G2P60604 165 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 WFDC2Q14508 124 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB116Q30KQ4 102 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 OR10J3Q5JRS4 329 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf194Q5T5A4 169 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SAMD13Q5VXD3 122 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SNX29P2Q8IUI4 249 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 C10orf126Q8N4M7 172 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PACRGLQ8N7B6 248 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 Q8N976 141 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SRRQ9GZT4 340 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 PRO0255Q9UI72 69 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 HHLA3Q9XRX5 114 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 KLF12Q9Y4X4 402 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa1.99□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 SFTA3P0C7M3 94 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 IAPPP10997 89 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CXCL3P19876 107 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RAB4AP20338 218 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RAB5AP20339 215 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 S100A7P31151 101 aa1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CLVS1-209ENST00000522928 CRYBA4P53673 196 aa1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms