RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618		A8MWV9	139 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A087WWC5	75 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	WFDC2	Q14508	124 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	RMI2	Q96E14	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	PARL	Q9H300	379 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	GCHFR	P30047	84 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	IFITM3	Q01628	133 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	MB	P02144	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE1	Q13065	139 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE4	Q13068	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE5	Q13069	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618		Q8N3U1	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	CXorf1	O96002	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	ASIP	P42127	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFA1	P59665	94 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFA3	P59666	94 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618		Q8N976	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	LECT2	O14960	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	SERF2	P84101	59 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	RHOD	O00212	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1W2PRE2	83 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	NIT1	Q86X76	327 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPATA20-223	ENST00000513618	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	ELOB	Q15370	118 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	JPT2	Q9H910	190 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618		B4DEV8	164 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618		Q9UF83	564 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A087WX48	190 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618		H3BVH4	76 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	IFNA7	P01567	189 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SPATA20-223	ENST00000513618	OXT	P01178	125 aa		11.54	□□□□□ -0.56

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