RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 OCC1Q8TAD7 63 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM12Q96EX1 92 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 MLST8Q9BVC4 326 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 BIN3Q9NQY0 253 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.11□□□□□ -1.11
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GARNL3-217ENST00000481875 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.08□□□□□ -1.12
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GARNL3-217ENST00000481875 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.05□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 SEC11CQ9BY50 192 aa8.05□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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GARNL3-217ENST00000481875 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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GARNL3-217ENST00000481875 DEFB130BP0DP73 79 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 DEFB130AP0DP74 79 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 ISOC2Q96AB3 205 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 OSTCQ9NRP0 149 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 TCL1AP56279 114 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.03□□□□□ -1.12
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