RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL18P55774 89 aa11.73□□□□□ -0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 MED9Q9NWA0 146 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R036 132 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 RS1O15537 224 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 SFTA3P0C7M3 94 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 KMT2AQ03164 3969 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A096LPF7 62 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.71□□□□□ -0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 CENPWQ5EE01 88 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.71□□□□□ -0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV2-8P01709 118 aa11.7□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 ESRGQ1W209 222 aa11.68□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-204ENST00000442563 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-204ENST00000442563 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EQD1 137 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGEF1-204ENST00000442563 Q9H8V8 135 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.62□□□□□ -0.55
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.62□□□□□ -0.55
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RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.6□□□□□ -0.55
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RABGEF1-204ENST00000442563 TIRAPP58753 221 aa11.6□□□□□ -0.55
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RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT11Q96G61 164 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EN84 100 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLC6P0CF74 106 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZSN1 163 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 F2Z2F3 143 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.58□□□□□ -0.56
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