RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 KLLNB2CW77 178 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 K7EN84 100 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 CRISP2P16562 243 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 OR5I1Q13606 314 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SMUG1Q53HV7 270 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TTC32Q5I0X7 151 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 LINC01551Q86U37 167 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12BA1L429 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 F5H768 121 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GAGE7O76087 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GCGP01275 180 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12FP0CL80 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12GP0CL81 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12IP0CL82 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 MUC21Q5SSG8 566 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZQT7 251 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SMIM12Q96EX1 92 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 MLST8Q9BVC4 326 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 NAGKQ9UJ70 344 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 NUDT3O95989 172 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ATP5G1P05496 136 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 S100A1P23297 94 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SVBPQ8N300 66 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ISOC2Q96AB3 205 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 BIN3Q9NQY0 253 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 HERC1Q15751 4861 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SNAPINO95295 136 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
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PRAME-210ENST00000442481 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SH2D1AO60880 128 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 CRIP1P50238 77 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ERVFC1-1P60608 527 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZTI0 123 aa8.15□□□□□ -1.1
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PRAME-210ENST00000442481 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.15□□□□□ -1.1
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PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPQ1 181 aa8.14□□□□□ -1.11
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PRAME-210ENST00000442481 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 ZNF415Q09FC8 603 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 SFRP2Q96HF1 295 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 B4DEV8 164 aa8.13□□□□□ -1.11
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PRAME-210ENST00000442481 P01737 135 aa8.13□□□□□ -1.11
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PRAME-210ENST00000442481 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 RHEBQ15382 184 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 NUDT11Q96G61 164 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 OSTCQ9NRP0 149 aa8.13□□□□□ -1.11
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PRAME-210ENST00000442481 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YY99 117 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 EPM2AB3EWF7 344 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-53P01767 116 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 ORM1P02763 201 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 TCL1AP56279 114 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 Q6AWC8 147 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 Q9H8V8 135 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-210ENST00000442481 EREGO14944 169 aa8.11□□□□□ -1.11
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