RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 Q9H8V8 135 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 GNG13Q9P2W3 67 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GVY2 172 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 ORM1P02763 201 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 RAB5CP51148 216 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 DERL1Q9BUN8 251 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 MLST8Q9BVC4 326 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 B4DEV8 164 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 H3BVH4 76 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 GYPEP15421 78 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 SLAQ13239 276 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01559Q495D7 138 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZSN1 163 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 PTH2Q96A98 100 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 JPT2Q9H910 190 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 ASIPP42127 132 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 DNLZQ5SXM8 178 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 BAGE2Q86Y30 109 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf52Q96A22 123 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 MANBALQ9NQG1 85 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 IL36BQ9NZH7 164 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-8P01709 118 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 PARLQ9H300 379 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 Q9UF83 564 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 RAB19A4D1S5 217 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 NXPH4O95158 308 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 SRIP30626 198 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf223Q8N319 242 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 BCL2P10415 239 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TNP2Q05952 138 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 CENPWQ5EE01 88 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PRR27Q6MZM9 219 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SIVA1O15304 175 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WWL8 130 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 A8MWV9 139 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TEX46H3BTG2 121 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 M0R381 172 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 CRYGDP07320 174 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00694P0DN24 101 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 RHOHQ15669 191 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SFRP2Q96HF1 295 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MED9Q9NWA0 146 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 VAX2Q9UIW0 290 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 HERC2O95714 4834 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPQ1 181 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SNAI2O43623 268 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PDE6DO43924 150 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 CIDEAO60543 219 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 IFNA1P01562 189 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GZMBP10144 247 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00315P59091 139 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.3□□□□□ -1.24
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