RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV12-3P01733 135 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6ZQT7 251 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 OOSP1A8MZH6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 H3BRM9 83 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 BUB3O43684 328 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 Q8N8P6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 OVOL1O14753 267 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 MYCNOSP40205 109 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 COL4A2P08572 1712 aa6.71□□□□□ -1.33
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1W2PPM0 123 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV2-11P01706 119 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC01587Q99440 93 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC01549A6NIU2 74 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 MRAP2Q96G30 205 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SPXQ9BT56 116 aa6.71□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV3-53P01767 116 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 HLA-DRB4P13762 266 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PLNP26678 52 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 JPT2Q9H910 190 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SMPXQ9UHP9 88 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 K7EP34 96 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CD28P10747 220 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PAX2Q02962 417 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SIGMAR1Q99720 223 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 COL12A1Q99715 3063 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 ZZEF1O43149 2961 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV1-69P01742 117 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 AGRNO00468 2067 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CRYGBP07316 175 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 NPBQ8NG41 125 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 F8VRH5 84 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R17O96001 155 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 WFDC2Q14508 124 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 COX6B1P14854 86 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFB131AP59861 70 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFB136Q30KP8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1B0GV72 72 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 VCYO14598 125 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CEND1Q8N111 149 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 COX6CP09669 75 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 ODF1Q14990 250 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 C12orf74Q32Q52 190 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CDKN1BP46527 198 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC140Q96MF4 163 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHV4-59P01825 116 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 F8P00451 2351 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A087WX48 190 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM223BA6NKX1 122 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 AJUBAQ96IF1 538 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 C9JAW5 83 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF223E7ERA6 249 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD42-202ENST00000393389 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms