RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G2AP14555 144 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 CFHR3Q02985 330 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL15Q9H469 300 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 ERG28Q9UKR5 140 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 A8MWV9 139 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 FCN3O75636 299 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 FXYD7P58549 80 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZUT4 128 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NPBQ8NG41 125 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 M0R381 172 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA3O95167 84 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 APELAP0DMC3 54 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 COX6B1P14854 86 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2D1P51668 147 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2D3P61077 147 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2D2P62837 147 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TEX29Q8N6K0 151 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TOMM6Q96B49 74 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ROS1P08922 2347 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 OOSP1A8MZH6 123 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 J3QKU1 62 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF688P0C7X2 276 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE5Q13069 117 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE6Q13070 117 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 Q5PR19 223 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NRACQ8N912 160 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CNTFRP26992 372 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 EFNA4P52798 201 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 AMTNQ6UX39 209 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 DPM3Q9P2X0 92 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CTSZQ9UBR2 303 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA4P78363 2273 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF815PA8K554 130 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LY6LH3BQJ8 138 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DMBP28068 263 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB2P49721 201 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L23D6RBM5 183 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5G2Q06055 141 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 Q6Q795 121 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 Q8TAT8 98 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPR1 153 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ERCC8Q13216 396 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM141Q96I45 108 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CCL19Q99731 98 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 A4D1N5 150 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM23O14925 209 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SNCGO76070 127 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 SRD5A1P18405 259 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.48□□□□□ -1.53
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