RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 RS1O15537 224 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SSNA1O43805 119 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 UPK1BO75841 260 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 RHOHQ15669 191 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF876PQ49A33 203 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 WFDC1Q9HC57 220 aa6.91□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 LELP1Q5T871 98 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 HERC1Q15751 4861 aa6.9□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 FAT1Q14517 4588 aa6.9□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 TAAR5O14804 337 aa6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 CIDEAO60543 219 aa6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GCGP01275 180 aa6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.89□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 K7EQM0 130 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 WFDC2Q14508 124 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 PRNTQ86SH4 94 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 SYT8Q8NBV8 401 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf85Q96MD7 179 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.88□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GAGE12JA6NER3 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 LECT2O14960 151 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 STAG3L2P0CL84 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 STAG3L3P0CL85 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GAGE1Q13065 139 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 GAGE5Q13069 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GAGE13Q4V321 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 SMUG1Q53HV7 270 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 TM2D2Q9BX73 214 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.87□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 GCHFRP30047 84 aa6.86□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 LAGE3Q14657 143 aa6.86□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 PARLQ9H300 379 aa6.86□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 GGTLC3B5MD39 225 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV2-11P01706 119 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 DEFA3P59666 94 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 PTH2Q96A98 100 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 EPDR1Q9UM22 224 aa6.85□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 A8MWV9 139 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 C1QBP02746 253 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 ATP6V0CP27449 155 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 SUN5Q8TC36 379 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 BAALCQ8WXS3 180 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.84□□□□□ -1.31
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CLRN3-201ENST00000368671 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.84□□□□□ -1.31
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 CXorf1O96002 111 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00694P0DN24 101 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 ASIPP42127 132 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01620Q4KN68 170 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 TOR2AQ5JU69 321 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00479Q96M42 142 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 Q9UF83 564 aa6.83□□□□□ -1.32
CLRN3-201ENST00000368671 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.82□□□□□ -1.32
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