RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PKHD1P08F94 4074 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 INAFM1C9JVW0 142 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CRYBB3P26998 211 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 KIR3DS1Q14943 382 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MORN5Q5VZ52 161 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GATD1Q8NB37 220 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GNB4Q9HAV0 340 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IL4P05112 153 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C8orf88P0DMB2 117 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 INSL3P51460 131 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 HILS1P60008 231 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ICAM4Q14773 271 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZSV7 163 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TMEM262E9PQX1 116 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 F8W1H4 67 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 H3BRM9 83 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GPX1P07203 203 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 BCL2P10415 239 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GCHFRP30047 84 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LINC01559Q495D7 138 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-11P01762 117 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 ZNF503Q96F45 646 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 ELANEP08246 267 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 IGLL1P15814 213 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TMEM250H0YL14 139 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 H3BRN7 92 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 H3BTX0 84 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 H7C1H1 209 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 NDUFC2O95298 119 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TRBV12-3P01733 135 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 CTRLP40313 264 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 VGLL1Q99990 258 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 NDUFA7O95182 113 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 PAXXQ9BUH6 204 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 C16orf95Q9H693 158 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 C3orf79P0CE67 100 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 SMIM13P0DJ93 91 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 PYYP10082 97 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 FGF6P10767 208 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 CARD19Q96LW7 228 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 RABAC1Q9UI14 185 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 PFN2P35080 140 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 H3BMG7 143 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 CRLF1O75462 422 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 GP9P14770 177 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 UBE2G1P62253 170 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 FXYD5Q96DB9 178 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 OR4F4Q96R69 305 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 C11orf94C9JXX5 98 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 ATP5G3P48201 142 aa4.63□□□□□ -1.67
CCR6-201ENST00000341935 PMAIP1Q13794 54 aa4.63□□□□□ -1.67
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