RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.65□□□□□ -0.06
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USP45-202ENST00000329966 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.58□□□□□ -0.07
USP45-202ENST00000329966 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
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USP45-202ENST00000329966 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
USP45-202ENST00000329966 PARLQ9H300 379 aa14.58□□□□□ -0.07
USP45-202ENST00000329966 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.58□□□□□ -0.08
USP45-202ENST00000329966 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.58□□□□□ -0.08
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USP45-202ENST00000329966 SMIM12Q96EX1 92 aa14.57□□□□□ -0.08
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USP45-202ENST00000329966 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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USP45-202ENST00000329966 NUDT11Q96G61 164 aa14.52□□□□□ -0.08
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USP45-202ENST00000329966 SFRP2Q96HF1 295 aa14.51□□□□□ -0.09
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USP45-202ENST00000329966 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.49□□□□□ -0.09
USP45-202ENST00000329966 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP45-202ENST00000329966 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP45-202ENST00000329966 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.49□□□□□ -0.09
USP45-202ENST00000329966 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.49□□□□□ -0.09
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