RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NCR2O95944 276 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV25A0A0B4J276 109 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 NPYP01303 97 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 C3orf79P0CE67 100 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DRB4P13762 266 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 PMCHL1Q16048 86 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 SPINK13Q1W4C9 94 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 FA2HQ7L5A8 372 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DL5AQ8N109 375 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD8-201ENST00000313173 OR4C46A6NHA9 309 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 KNCNA6PVL3 124 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 A8MTW9 85 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 TDRG1Q3Y452 100 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 AP5S1Q9NUS5 200 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 MAP6D1Q9H9H5 199 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 AGRNO00468 2067 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N976 141 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 M0R381 172 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 TCF21O43680 179 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 SORL1Q92673 2214 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 H3BMM0 161 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 NXPH4O95158 308 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 TEX43Q6ZNM6 134 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 CD7P09564 240 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 SPRY2O43597 315 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 MAP1LC3AQ9H492 121 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 GAS8-AS1O95177 125 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 LEPROTL1O95214 131 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD8-201ENST00000313173 TNFRSF6BO95407 300 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 BTF3P20290 206 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 M0R143 59 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF124Q15973 351 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 EREGO14944 169 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 MRAP2Q96G30 205 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 AP1S3Q96PC3 154 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 DPH3P1Q9H4G8 78 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 OR2K2Q8NGT1 345 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf85Q96MD7 179 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf144Q9BQM9 153 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 FXYD7P58549 80 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00173Q6ZV60 143 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM70Q9BUB7 260 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 SNHG12Q9BXW3 62 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 HSPB8Q9UJY1 196 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 WNK1Q9H4A3 2382 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 CRXO43186 299 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 ODF3L2Q3SX64 289 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 NRACQ8N912 160 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 TCAPO15273 167 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP10-3P60369 221 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA11Q86Y39 141 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N1Y9 231 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 MUC4Q99102 2169 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD8-201ENST00000313173 LINC01546A6NGU7 62 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 A0A096LNJ9 63 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1CP0DJD4 496 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 SAP30O75446 220 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB125Q8N687 156 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 CLUHP3Q96NS8 147 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 VAMP8Q9BV40 100 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 PRSS47A8MTI9 375 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 MDFICQ9P1T7 246 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV11A0A075B6L2 103 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 C2CD3Q4AC94 2353 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N8P6 123 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 MIEN1Q9BRT3 115 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 HBDP02042 147 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA12Q7Z6I5 190 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD8-201ENST00000313173 POM121L12Q8N7R1 296 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms