RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 IL36BQ9NZH7 164 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.47■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 ASIPP42127 132 aa15.47■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.47■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 TEX261Q6UWH6 196 aa15.47■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 PRO0255Q9UI72 69 aa15.47■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.46■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 A0A096LPF7 62 aa15.46■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 RS1O15537 224 aa15.46■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 SCRT2Q9NQ03 307 aa15.46■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.46■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.45■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 RPL19P84098 196 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.45■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 OR4C5Q8NGB2 326 aa15.45■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 H3BVH4 76 aa15.44■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 PAX4O43316 350 aa15.44■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 SLAQ13239 276 aa15.44■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 LINC00588Q9Y4M8 146 aa15.44■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 PRR27Q6MZM9 219 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 GNG4P50150 75 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 ESRGQ1W209 222 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 SMIM12Q96EX1 92 aa15.43■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 TMEM250H0YL14 139 aa15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 FAM210AQ96ND0 272 aa15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 JPT2Q9H910 190 aa15.42■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 CXCL1P09341 107 aa15.41■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 TOR2AQ5JU69 321 aa15.41■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.4■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 ZNRF2Q8NHG8 242 aa15.4■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 PARLQ9H300 379 aa15.4■□□□□ 0.06
SYF2-201ENST00000236273 FRAS1Q86XX4 4008 aa15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 CCL18P55774 89 aa15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 OCC1Q8TAD7 63 aa15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.39■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 DNAH17Q9UFH2 4485 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 K7EN84 100 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 K7EQD1 137 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 CIDEAO60543 219 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 MED14OSP0DP75 135 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZSN1 163 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.38■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SNAI2O43623 268 aa15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZR54 194 aa15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A29Q8N8R3 303 aa15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.37■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 A8MWV9 139 aa15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 GYPEP15421 78 aa15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SFRP2Q96HF1 295 aa15.36■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 NXPH4O95158 308 aa15.35■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 OR10AG1Q8NH19 301 aa15.35■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 C9JQL5 133 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 M0R2N4 97 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 M0R381 172 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 CRYGDP07320 174 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 OR5AL1P0C617 328 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 GZMBP10144 247 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 SYT8Q8NBV8 401 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 NUDT11Q96G61 164 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 UPK3BQ9BT76 320 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.34■□□□□ 0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGLC6P0CF74 106 aa15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 ZFP82Q8N141 532 aa15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 OR2D3Q8NGH3 330 aa15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 BIN3Q9NQY0 253 aa15.32■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 Q9UF83 564 aa15.32■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 P01737 135 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 CEBPGP53567 150 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 Q9H8V8 135 aa15.31■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WWL8 130 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms