RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	TNP2	Q05952	138 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	RASL10A	Q92737	203 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPX	Q9BT56	116 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	PSG8	Q9UQ74	426 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	EPDR1	Q9UM22	224 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	GCG	P01275	180 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A1W2PRE2	83 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941		K7EQM0	130 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	UBE2G2	P60604	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRNT	Q86SH4	94 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP3-215	ENST00000596941		M0R2P5	195 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	TAAR5	O14804	337 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLA	Q13239	276 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCNS1	Q96KK3	526 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00479	Q96M42	142 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	NXPH4	O95158	308 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM74A7	A6NL05	159 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	SMUG1	Q53HV7	270 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941		K7EQD1	137 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	PEX7	O00628	323 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	IFNA7	P01567	189 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	GYPE	P15421	78 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	FHIT	P49789	147 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF345	Q14585	488 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q86TA4	180 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	RYR1	P21817	5038 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	SIVA1	O15304	175 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941		C9JCJ5	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	SRI	P30626	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00315	P59091	139 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	ORM1	P02763	201 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	RS1	O15537	224 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	PPT1	P50897	306 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	BCL2L11	O43521	198 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	CRIP1	P50238	77 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A0D9SG52	128 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A1B0GV50	99 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GTPBP3-215	ENST00000596941	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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