RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580949.1

PTPRM-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-213	ENST00000580949	FRZB	Q92765	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ID1	P41134	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	PRR9	Q5T870	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		A8MWL6	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		M0QZ24	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB5B	P61020	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		A0A0J9YX75	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		A0A1B0GXF2	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	CRISP2	P16562	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SORL1	Q92673	2214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		A0A1B0GUS0	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SPRY2	O43597	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	ORM1	P02763	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	DEFB131A	P59861	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949		A8MTW9	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-213	ENST00000580949	KLLN	B2CW77	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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