RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571442.5

SMG6-209, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, human

TSL 4

Gene SMG6, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMG6-209	ENST00000571442	SPINK4	O60575	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	AKR1C3	P42330	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMG6-209	ENST00000571442	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		K7EQM0	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LTA	P01374	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		F5H768	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SH2D1A	O60880	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	BCL2	P10415	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		A0A0J9YY99	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		M0R036	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LY6G6C	O95867	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ATP5G1	P05496	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	PPT1	P50897	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	UBE2G1	P62253	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	OR5I1	Q13606	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FHL2	Q14192	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RASL10A	Q92737	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	JPT2	Q9H910	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		B4DEV8	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		C9JCJ5	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		C9JQL5	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		H3BVH4	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442		M0R2P5	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ORM1	P02763	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	SPX	Q9BT56	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMG6-209	ENST00000571442	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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