RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560311.1

IRF9-208, Transcript of interferon regulatory factor 9, human

TSL 2

Gene IRF9, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF9-208	ENST00000560311	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF138	P52744	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		Q6ZTI0	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	RYR1	P21817	5038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		G3V3Q6	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	NUDT3	O95989	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GNG5	P63218	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		Q6ZQT7	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	HSPG2	P98160	4391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		A0A0J9YY99	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		F6UZH7	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		M0R2N4	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	MB	P02144	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GCHFR	P30047	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TCL1A	P56279	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	RNF212	Q495C1	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	PGP	A6NDG6	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ARPC5	O15511	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	SPINK4	O60575	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	SERF2	P84101	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	OR5I1	Q13606	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		Q6AWC8	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		Q6ZR54	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311		Q6ZSN1	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRF9-208	ENST00000560311	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	RTL8C	O15255	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	CXorf1	O96002	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	TCRA	P04437	139 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	S100A1	P23297	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	CCL18	P55774	89 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311		A0A1B0GVY2	172 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRF9-208	ENST00000560311		H3BNG1	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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