RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 GPX1P07203 203 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 MIFP14174 115 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 BTN1A1Q13410 526 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 UQCC3Q6UW78 93 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 FAT1Q14517 4588 aa9.77□□□□□ -0.84
CS-231ENST00000552222 H7BYZ3 331 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 PRNTQ86SH4 94 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 C11orf52Q96A22 123 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 FMC1Q96HJ9 113 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TREM1Q9NP99 234 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 VAX2Q9UIW0 290 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 AKR1C3P42330 323 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TAS2R60P59551 318 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 Q6AWC8 147 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 Q86TA4 180 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 LINC01587Q99440 93 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 MYCBP2O75592 4640 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 PDE6DO43924 150 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 PRM2P04554 102 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 UBE2G1P62253 170 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 RRN3P1Q2M238 152 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TOR2AQ5JU69 321 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 Q6ZQT7 251 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 C8orf49Q96NF6 230 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 AZU1P20160 251 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TMEM189A5PLL7 270 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 LTAP01374 205 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 HTN1P15515 57 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-2P60368 255 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 SMUG1Q53HV7 270 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 NACAE9PAV3 2078 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 EPM2AB3EWF7 344 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 GCGP01275 180 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 DERL1Q9BUN8 251 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-231ENST00000552222 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 MLST8Q9BVC4 326 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TMEM250H0YL14 139 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 EMP1P54849 157 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TDRG1Q3Y452 100 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 MUC21Q5SSG8 566 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 BAGE2Q86Y30 109 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 C16orf74Q96GX8 76 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TMEM218A2RU14 115 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 CBY3A6NI87 242 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 CRIP1P50238 77 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 DKK2Q9UBU2 259 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 HTN3P15516 51 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 PEA15Q15121 130 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 CENPWQ5EE01 88 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 NAGKQ9UJ70 344 aa9.68□□□□□ -0.86
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