RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 RBAKDNA6NC62 111 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 KLLNB2CW77 178 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 BCL2L11O43521 198 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PFDN1O60925 122 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 DEFB130BP0DP73 79 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 DEFB130AP0DP74 79 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 HTN3P15516 51 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 CRISP2P16562 243 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 FHITP49789 147 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 DAD1P61803 113 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 SUN5Q8TC36 379 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 UBE2G2P60604 165 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 CST9LP1Q5W188 147 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C16orf74Q96GX8 76 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GVG6 124 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 CBY3A6NI87 242 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 LYRM9A8MSI8 78 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 NMBP08949 121 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 SEC11BP0C7V7 166 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TMED6Q8WW62 240 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TVP23CQ96ET8 276 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 APLNQ9ULZ1 77 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 EPDR1Q9UM22 224 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GV50 99 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRE2 83 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C9orf118A6NHY6 69 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GGTLC3B5MD39 225 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 IFNA7P01567 189 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C1QBP02746 253 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TCRAP04437 139 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 CAMPP49913 170 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 MUC21Q5SSG8 566 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 AKAP14Q86UN6 197 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 ZNF575Q86XF7 245 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GAGE12BA1L429 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 SNURFLB1AK76 121 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 F6UZH7 168 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GAGE7O76087 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GAGE12FP0CL80 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GAGE12GP0CL81 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 GAGE12IP0CL82 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PRNTQ86SH4 94 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 STOML3Q8TAV4 291 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 LINC00479Q96M42 142 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C8orf49Q96NF6 230 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 TREM1Q9NP99 234 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 PSG8Q9UQ74 426 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 FAM74A7A6NL05 159 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 UMAD1C9J7I0 102 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 F5H768 121 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 K7EQM0 130 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 NAGKQ9UJ70 344 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-217ENST00000550044 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 A4D1N5 150 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 GNRH2O43555 120 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 IGLV2-11P01706 119 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 ATP5G1P05496 136 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 ATP5G3P48201 142 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 TCTAP57738 103 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 Q6AWC8 147 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-217ENST00000550044 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.77□□□□□ -1.33
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