RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS29Q9UBQ0 182 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-162P-201ENST00000516228 FMN1Q68DA7 1419 aa-3.22□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADGRB1O14514 1584 aa-3.22□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPATCH11Q8N954 259 aa-3.23□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2H1Q9GZK4 316 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.23□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 OR52A5Q9H2C5 316 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 V9GYV3 84 aa-3.24□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 PAPPAQ13219 1627 aa-3.25□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 UBE2G2P60604 165 aa-3.25□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGD6Q6ZV73 1430 aa-3.26□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 F8VZ95 297 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-3.26□□□□□ -2.93
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RNU6-162P-201ENST00000516228 LRP6O75581 1613 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 PFDN6O15212 129 aa-3.29□□□□□ -2.94
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RNU6-162P-201ENST00000516228 Q3ZCU0 254 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAB8BQ92930 207 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 MPC1Q9Y5U8 109 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-162P-201ENST00000516228 NSD3Q9BZ95 1437 aa-3.29□□□□□ -2.94
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