RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515005.1

SMAD5-210, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD5, Length 368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-210ENST00000515005 SRPXP78539 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 STPG4Q8N801 248 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 MGST2Q99735 147 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 DISC1C4P0D8 188 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 FNDC10F2Z333 226 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 CTDSPLO15194 276 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 COX6A2Q02221 97 aa7.21□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 ATP5SQ99766 215 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 PSENENQ9NZ42 101 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 NRG4Q8WWG1 115 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 LINC00479Q96M42 142 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD5-210ENST00000515005 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 SMIM8Q96KF7 97 aa7.15□□□□□ -1.26
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SMAD5-210ENST00000515005 F6UZH7 168 aa7.14□□□□□ -1.27
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SMAD5-210ENST00000515005 NEDD8Q15843 81 aa7.14□□□□□ -1.27
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SMAD5-210ENST00000515005 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 JPT2Q9H910 190 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 VAMP1P23763 118 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD5-210ENST00000515005 TVP23CQ96ET8 276 aa7.12□□□□□ -1.27
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