RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NACAE9PAV3 2078 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TYMSP04818 313 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CRIP1P50238 77 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF415Q09FC8 603 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MDFICQ9P1T7 246 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GNRH2O43555 120 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PDE6DO43924 150 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SH2D1AO60880 128 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CENPWQ5EE01 88 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TOR2AQ5JU69 321 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 Q6ZTI0 123 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GAGE12BA1L429 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RAB19A4D1S5 217 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GAGE7O76087 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GAGE12FP0CL80 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GAGE12GP0CL81 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GAGE12IP0CL82 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HTN3P15516 51 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BAGE2Q86Y30 109 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MLST8Q9BVC4 326 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MED9Q9NWA0 146 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPINK4O60575 86 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNS1Q96KK3 526 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM210AQ96ND0 272 aa9.46□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.45□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 M0R036 132 aa9.45□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGLV2-8P01709 118 aa9.45□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGLL5B9A064 214 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ORM1P02763 201 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRR27Q6MZM9 219 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 B4DEV8 164 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMEM250H0YL14 139 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP5G1P05496 136 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GNG4P50150 75 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IFITM2Q01629 132 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LINC01559Q495D7 138 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C9orf85Q96MD7 179 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPXQ9BT56 116 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PARLQ9H300 379 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CEBPGP53567 150 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF575Q86XF7 245 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RYR2Q92736 4967 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C9JCJ5 164 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 F5H768 121 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 H3BVH4 76 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 M0R2P5 195 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGHV3-53P01767 116 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HOXA5P20719 270 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ASIPP42127 132 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C18orf15Q96N68 181 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 APLNQ9ULZ1 77 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C9JQL5 133 aa9.4□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OR5I1Q13606 314 aa9.4□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RASL10AQ92737 203 aa9.4□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SMIM12Q96EX1 92 aa9.4□□□□□ -0.9
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 K7EN84 100 aa9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DNLZQ5SXM8 178 aa9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RYR3Q15413 4870 aa9.39□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LCE6AA0A183 80 aa9.38□□□□□ -0.91
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms