RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FAM201AQ5SY85 155 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 Q8N6K4 173 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPI3 338 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C9JAW5 83 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 NDUFA7O95182 113 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TMEM262E9PQX1 116 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 NDUFB3O43676 98 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGHV1-69P01742 117 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HBDP02042 147 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MORN5Q5VZ52 161 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 DKK2Q9UBU2 259 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 EPDR1Q9UM22 224 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CADP27708 2225 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FCGR3BO75015 233 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CRYGBP07316 175 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C4orf26Q17RF5 130 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 UTF1Q5T230 341 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CCL13Q99616 98 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ASCL2Q99929 193 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.94□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C15orf61A6NNL5 157 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNF688P0C7X2 276 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ERVK-16P61578 105 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 GNG5P63218 68 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TEN1Q86WV5 123 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PAXXQ9BUH6 204 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 AGRNO00468 2067 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.465e-7■■■■□ 22.8
USP4-211ENST00000485450 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PYYP10082 97 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MOB3BQ86TA1 216 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP4-211ENST00000485450 TMEM89A2RUT3 159 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 RFESDQ8TAC1 157 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FXYD5Q96DB9 178 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FMC1Q96HJ9 113 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ODF3Q96PU9 254 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SMR3AQ99954 134 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 U3KQK5 164 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GX51 115 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PROP1O75360 226 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGLC6P0CF74 106 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 RIGQ13278 110 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNF714Q96N38 554 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 GAGE2BQ13066 116 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 GAGE2EQ4V326 116 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ENY2Q9NPA8 101 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.92□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZANQ9Y493 2812 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 LINC01619G3V211 115 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 POU2AF1Q16633 256 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 NPFFO15130 113 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MRAPQ8TCY5 172 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 SGK494Q96LW2 274 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 LINC00477Q96M19 166 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PRNDQ9UKY0 176 aa5.91□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TTC32Q5I0X7 151 aa5.9□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.9□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.9□□□□□ -1.47
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