RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CGB1A6NKQ9 187 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 OR7C2O60412 319 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 KLK9Q2XQG4 91 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 LEMD1Q68G75 181 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 COX11Q9Y6N1 276 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 HSBP1O75506 76 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2G1P62253 170 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 STPG4Q8N801 248 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH2Q9P225 4427 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4C46A6NHA9 309 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PEX7O00628 323 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CDKN1BP46527 198 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MLST8Q9BVC4 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2T8A6NH00 312 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 A8MWL6 223 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PLP1P60201 277 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SLAQ13239 276 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 NUP35Q8NFH5 326 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 NUDT11Q96G61 164 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR82Q96P67 336 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PAXXQ9BUH6 204 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CSTL1Q9H114 145 aa8.61□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 HBBP68871 147 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.61□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 FMC1Q96HJ9 113 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 M0R2Z0 102 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PPBPP02775 128 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 FXYD5Q96DB9 178 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TRGV9Q99603 122 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 EPDR1Q9UM22 224 aa8.6□□□□□ -1.03
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RABGEF1-207ENST00000484547 RBX1P62877 108 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMG4Q5JS54 123 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLL5B9A064 214 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 LTAP01374 205 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 BATFQ16520 125 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 APLNQ9ULZ1 77 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF24Q9Y225 148 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 PKD1P98161 4303 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.57□□□□□ -1.04
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