RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483564.5

GABRE-208, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 3

Gene GABRE, Length 2,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-208ENST00000483564 IGLC6P0CF74 106 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 UBE2D1P51668 147 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 DTX2Q86UW9 622 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PRR25Q96S07 402 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 F5H768 121 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 I3L2K1 104 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 J3KT08 172 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHV1-46P01743 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHG4P01861 327 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ZNF56Q15929 161 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.14□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LINC01546A6NGU7 62 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 H3BRN7 92 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 H7C2G1 150 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 K7EM74 188 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 NDUFA7O95182 113 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 TRGV3P03979 118 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 TEX22C9J3V5 150 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CCL11P51671 97 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 BAALCQ8WXS3 180 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.13□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ZNF815PA8K554 130 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 Q8N8P6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 RNF125Q96EQ8 232 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 DKK4Q9UBT3 224 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 RBAKDNA6NC62 111 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 TIMM23O14925 209 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ERCC8Q13216 396 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 K7EIM0 57 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 GATA4P43694 442 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LAGE3Q14657 143 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 SPRY2O43597 315 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CFC1BP0CG36 223 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CFC1P0CG37 223 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ATMQ13315 3056 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHV4-39P01824 125 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CRYGBP07316 175 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 RELNP78509 3460 aa7.1□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHV3-23P01764 117 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 SLC25A16P16260 332 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PMVKQ15126 192 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 NRACQ8N912 160 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PRAC2D3DTV9 90 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 F8VRH5 84 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 H7C1H1 209 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 PLNP26678 52 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 C4orf26Q17RF5 130 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CFHR4Q92496 578 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 CEP250Q9BV73 2442 aa7.09□□□□□ -1.27
GABRE-208ENST00000483564 LINC01619G3V211 115 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 M0R2P5 195 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 ELANEP08246 267 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 TIMD4Q96H15 378 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 DUX3Q96PT4 197 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 TTC28Q96AY4 2481 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 PLGLAQ15195 96 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 CCL17Q92583 94 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 CNFNQ9BYD5 112 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.08□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 CD3EP07766 207 aa7.07□□□□□ -1.28
GABRE-208ENST00000483564 CD40P25942 277 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms