RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 LINC01559Q495D7 138 aa14.8□□□□□ -0.04
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TRPC1-203ENST00000476941 OR11H1Q8NG94 326 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 OR11H2Q8NH07 326 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 RAXQ9Y2V3 346 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 Q8N8P6 123 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-203ENST00000476941 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.79□□□□□ -0.04
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TRPC1-203ENST00000476941 HLA-DMBP28068 263 aa14.77□□□□□ -0.04
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TRPC1-203ENST00000476941 PLNP26678 52 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-203ENST00000476941 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.76□□□□□ -0.05
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TRPC1-203ENST00000476941 PDE6HQ13956 83 aa14.75□□□□□ -0.05
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TRPC1-203ENST00000476941 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-203ENST00000476941 KLK15Q9H2R5 256 aa14.73□□□□□ -0.05
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TRPC1-203ENST00000476941 PRTN3P24158 256 aa14.72□□□□□ -0.05
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TRPC1-203ENST00000476941 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 50.6
TRPC1-203ENST00000476941 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF815PA8K554 130 aa14.69□□□□□ -0.06
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TRPC1-203ENST00000476941 ZNF688P0C7X2 276 aa14.68□□□□□ -0.06
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TRPC1-203ENST00000476941 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.67□□□□□ -0.06
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TRPC1-203ENST00000476941 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 VCX2Q9H322 139 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 CLEC3BP05452 202 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 UBE2D1P51668 147 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 UBE2D3P61077 147 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 UBE2D2P62837 147 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 LY6DQ14210 128 aa14.65□□□□□ -0.06
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