RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 UTF1Q5T230 341 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CRLF1O75462 422 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 C17orf77Q96MU5 243 aa14.57□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 F6UB75 175 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CGB3P0DN86 165 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 HLA-DMBP28068 263 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 RBAKDNA6NC62 111 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 HAMPP81172 84 aa14.56□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PPM0 123 aa14.55□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 F8W1H4 67 aa14.55□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 MYLKQ15746 1914 aa14.55□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.55□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CEND1Q8N111 149 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 GNRH2O43555 120 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 K7EMI3 77 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 U3KQE9 123 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 FOXE3Q13461 319 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 K7EN84 100 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CCL24O00175 119 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CGB7P0DN87 165 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 PRSS33Q8NF86 280 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 DSCR8Q96T75 97 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-204ENST00000400183 CCL25O15444 150 aa14.52□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.52□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 CFHR4Q92496 578 aa14.52□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 DKK2Q9UBU2 259 aa14.52□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 ZMAT4Q9H898 229 aa14.52□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 SIVA1O15304 175 aa14.51□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.51□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 CARD19Q96LW7 228 aa14.51□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 LHBP01229 141 aa14.51□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.5□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 ZNF747Q9BV97 191 aa14.5□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 K7ERJ3 54 aa14.5□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 XCL1P47992 114 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 A0A0J9YY99 117 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 H3BMG7 143 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 PLCE1Q9P212 2302 aa14.49□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 NPBQ8NG41 125 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 DEFB136Q30KP8 78 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 MED13Q9UHV7 2174 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.48□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 NUPR1O60356 82 aa14.47□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 RNF138Q8WVD3 245 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 WDR81Q562E7 1941 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 TDRG1Q3Y452 100 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 I3L2K1 104 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 AMTNQ6UX39 209 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 RNF152Q8N8N0 203 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-204ENST00000400183 Q9H8V8 135 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 K7EIM0 57 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 CRYGCP07315 174 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 SPRNQ5BIV9 151 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 IGHG4P01861 327 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 C12orf74Q32Q52 190 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 DEFB125Q8N687 156 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 AJUBAQ96IF1 538 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 ACACBO00763 2458 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 IGKV1-17P01599 117 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 UBE2BP63146 152 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 NOTCH2Q04721 2471 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.44□□□□□ -0.1
USP25-204ENST00000400183 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.2 ms